En 2005 un grupo de investigadores de la universidad de cornell consiguió descifrar hasta el 99% del Genoma canino, Gracias a una hembra de boxer llamada "Tasha". La elección no fue al azar, si no que los investigadores consultaron con veterinarios y criadores, y estos, sugirieron a la raza boxer, por la pureza de la raza.
En este estudio, se llegaron a 2 conclusiones. Una, que el hombre comparte con el perro un 94% de su "mapa genético", comparte mas incluso que con el ratón, y, por otro lado, que el numero de lineas originales de las que descienden todos los perros es muy limitado y concreto.
Las diferentes teorías establecieron que existían dos ramas diferentes de las que descienden todos los perros actuales. Una seria de los primeros perros criados a partir de los lobos euroasiáticos hace miles de años y otra seria la creada por el hombre, al seleccionar de manera consciente a los perros descendientes de los lobos euroasiáticos hace unos pocos cientos de años. También se estableció que los orígenes del perro podían ser muchos mas antiguos, de lo que pensábamos, llegando incluso a remontarse hasta hace 100.000 años.
Pero esta no ha sido el ultimo estudio que se ha llevado a cabo, en Marzo de 2010 se hicieron públicos los resultados de una investigación sobre el origen del perro domestico, llevados a cabo por la Universidad de California-Los ángeles. La gran importancia de este estudio fue por la diversidad de la muestra: mas de novecientos perros de ochenta y cinco razas diferentes, mas de doscientos lobos procedentes de América, Europa Oriente Medio y Asia y un análisis de 48000 marcadores genéticos.
Los resultados de este estudio, dejan claro que la mayoría de las razas caninas del mundo descienden del Lobo Gris de Oriente Medio y, en menor medida, del Lobo Gris Europeo, Siendo apenas unas pocas razas asiaticas las que descienden directamente y de forma singular del lobo de esta zona, por lo que el numero de lineas originales por el momento son 3, y de estas evoluciono el perro en todo el mundo.
